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💻
Genbank形式のファイルからデータを取得して表形式にまとめる練習（Biopython）
mtojsvqi
1日前
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💻
snp distance matrixを系統樹のラベル順に並び替える
mtojsvqi
3日前
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snp distance matrixからseabornでヒートマップを作成
mtojsvqi
3日前
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Clustal Omega初心者ログ【#2 実際にアライメントしてみた】
ギンタカハマ🐚
5日前
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Clustal Omega初心者ログ【#1 インストール】
ギンタカハマ🐚
5日前
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🧬
【バイオインフォマティクス】ヒトT2TゲノムのResequence~Annotation
ANPLAT
2024/05/07
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📑
(1) CWLの作成環境をVScodeの｢Dev Containers｣の機能を使って構築する
Sora Yonezawa
2024/05/28
4
🧬
Snowpark Container ServiceのR言語環境でsingle cell RNA-seq解析をする
koreeda
2024/03/07
12
🧬
Snowflakeを用いたVCFフォーマットの遺伝子バリアントデータと表現型データベースとの統合
koreeda
2023/07/15
13
🤖
【R】 遺伝子ID/遺伝子名の変換方法
Ryota Chijimatsu
2023/03/13
11
💊
SnowflakeでStreamlitとSnowflake Notebooksを用いたIn silico創薬
koreeda
2024/07/19
6
📑
(3) ｢Dev Containers｣で構築したCWLの作成環境で､実践的なワークフローを作成､実行する
Sora Yonezawa
2024/05/28
2
📑
(2) ｢Dev Containers｣で構築したCWLの作成環境で､簡単なワークフローを作成､実行する
Sora Yonezawa
2024/05/28
2
🦆
RoseTTAFold All-Atom環境構築 | 2024-03-11
_machine
2024/03/11
4
💭
Snowpark Container Service上でRstudioを扱う
koreeda
2024/02/13
5
🔖
バイオインフォマティクスコンテスト2021-Problem3 Diagnosis
Kazuki UENO
2021/08/02
3
😷
【論文解説】 MUSK：病理診断のためのマルチモーダル基盤モデル
どくとりん
3ヶ月前
3
🧬
【論文解説】 scFoundation：単一細胞トランスクリプトミクスの基盤モデル
どくとりん
3ヶ月前
3
🧬
SnowflakeでVCFファイルのバリアントフィルタリング ~Registry of Open Data on AWSの利用~
koreeda
2024/07/12
4
🛠️
SingularityでQIIME2の実行環境を作成する
はじ環
2024/04/22
3
🔧
小ネタ : parallelにfastpを実行する
はじ環
2024/02/10
1
🧬
細菌のショットガンメタゲノム Host genome除去
はじ環
2023/12/23
1
📘
お家のパソコンでESM2のLoRAをする
わに
4ヶ月前
2
🔥
【RNAseq】[immunedeconv] RNAseqデータから免疫細胞比率を推定
Ryota Chijimatsu
2023/08/08
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🧬
SRAにFASTQファイルを登録したときの備忘録
akikuno
2022/09/05
4
🔖
バイオインフォマティクスコンテスト2021参加記
Kazuki UENO
2021/07/01
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📚
深層バイオインフォマティクスは表現学習である
3254c
1ヶ月前
2
👥
PLINK2とPythonで集団遺伝学に入門する(1)データの前処理(HWE・アリル頻度分布)
張 子聡(Zicong Zhang)
4ヶ月前
1
🦠
16s rRNAのデータを使ったpicrust2による機能的存在量予測
はじ環
2024/09/23
🤖
EGAのDeposit dataをダウンロード
Ryota Chijimatsu
2024/08/07
🧬
IGVへのゲノム情報登録と遺伝子名検索の仕様
張 子聡(Zicong Zhang)
2024/06/22
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🐑
SeuratでUMAPが使えない問題
崎真暁斗
2024/03/04
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ロングリードメタゲノムのビニング
はじ環
2024/01/17
🎄
ProteinMPNN実行環境の構築 | Apptainer (on WSL2 & with GPU)
_machine
2023/12/27
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🧬
もう NCBI GEO の多くの FASTQ を処理しなくてもいいかもしれない #souyakuAC2023
136
2023/12/18
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🙆♀️
GenePatternをlocalに導入（docker使用）
Ryota Chijimatsu
2023/10/02
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🧬
ロングリードメタゲノムアセンブラー三兄弟の比較 : hifiasm_meta, metaMDBG, metaFlye
はじ環
2023/10/01
🧬
シングルセルRNA−seqデータのQuality Controlライブラリを調査してみた
koreeda
2023/09/23
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📖
【ゲノム解析】BAMファイルから1座標の塩基割合を求める
Ryota Chijimatsu
2023/09/12
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📝
【勉強】私立の外部大学院を受験した話(バイオインフォマティクス)
zenzen@R-2
2023/09/03
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🧬
Necatを用いた魚類ゲノムのde novo assembly
はじ環
2023/08/30
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🥜
LocalColabFold実行環境の構築 | Apptainer (on WSL2 & with GPU)
_machine
2023/05/01
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🎃
【シングルセル解析】[Seurat] 細胞の抽出 subset()の例
Ryota Chijimatsu
2023/03/16
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😊
【シングルセル解析】Seurat plot機能のtips
Ryota Chijimatsu
2023/02/16
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🧬
俺の転写因子が翻訳されたらIDP（天然変性タンパク質）だった件
carushi
2022/12/24
2
💻
遺伝的アルゴリズムで条件を満たすいい感じの部分集合をとってくる
roju
2022/09/29
3
📘
Strainy : ロングリードメタゲノムリードから株レベルのハプロタイプアセンブリとフェージング
はじ環
2024/09/28
🌊
バイオインフォマティクス技術者認定試験 参考リンク
バイオサプリ
2024/06/17
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