Chapter 65

【7回目】まとめと課題

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2022.10.25に更新

7回目の課題

問題1 以下のデータをpandasで読み込んで、最初の三行を表示せよ。

!wget https://raw.githubusercontent.com/chemoinformatics-lecture/lecture-beginner/main/lesson06_scikit-learn/homework/train_data_soac.csv

問題2 "AllChem.GetMorganFingerprintAsBitVect(mol, 2, 2048)"を利用して、SMILESからfinger printを作成せよ。

問題3 トレーニングデータとテストデータをテストデータ10%の割合で分割してトレーニングデータをを利用してcompare_modelsで比較して学習せよ。

問題4 compare_modelsで選ばれたmodelの中から、いずれかのmodelを選択しモデルのチューニングをせよ。

問題5 チューニングしたmodelの誤差プロットをプロットしてみよ。

問題6 重要度の高かったfinger printの構造を図示してみよ。

git hubのコード

https://github.com/chemoinformatics-lecture/lecture-beginner/tree/main/lesson07_automl