このチャプターの目次
5回目の課題
課題 1
以下のファイルを取得して8個の分子のSMILESからmopacを利用してHOMOを計算せよ。
また計算したファイルを読み取り、SMILES, Name, HOMO, LUMOの列を有するpandasのdataframeを作成せよ。
mopacのkeywordは、 "PM7 EF"とする。
ファイルは、以下のコードを利用して取得せよ。
!wget https://raw.githubusercontent.com/chemoinformatics-lecture/lecture-beginner/main/lesson08_practice/data/soac/test.csv
課題 ２
課題１で作成したdfにHOMO-LUMO gapの列を追加せよ。HOMO-LUMO gapは、LUMO マイナス HOMO で算出せよ。
また、HOMO-LUMO gapが、小さい順番にdfを並び替えよ。
git hubのコード