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【シングルセル解析】[Seurat] 細胞の抽出 subset()の例
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Snowflakeを用いたVCFフォーマットの遺伝子バリアントデータと表現型データベースとの統合
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6ヶ月前
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33c33
2023/01/06
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Snowpark Container ServiceのR言語環境でsingle cell RNA-seq解析をする
koreeda
2024/03/07
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【WSL】[bioinfomatics] Windows11にWSL環境を整える(2)
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2023/04/06
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シングルセルRNA−seqデータのQuality Controlライブラリを調査してみた
koreeda
2023/09/23
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SRAにFASTQファイルを登録したときの備忘録
akikuno
2022/09/05
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【バイオインフォマティクス】ヒトT2TゲノムのResequence~Annotation
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5ヶ月前
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【WSL】 割り当てるディスク領域を増やす
Ryota Chijimatsu
2024/02/15
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遺伝的アルゴリズムで条件を満たすいい感じの部分集合をとってくる
roju
2022/09/29
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生物系情弱でもデュアルブートしたい Windows11とUbuntu 22.04
成田智裕
2024/03/08
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ProteinMPNN実行環境の構築 | Apptainer (on WSL2 & with GPU)
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2023/12/27
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RstudioでGitHub Copilotが使えるようになったので試してみる
koreeda
2023/07/16
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【WSL】[bioinfomatics] Windows11にWSL環境を整える(1)
Ryota Chijimatsu
2023/04/03
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もう NCBI GEO の多くの FASTQ を処理しなくてもいいかもしれない #souyakuAC2023
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2023/12/18
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LocalColabFold実行環境の構築 | Apptainer (on WSL2 & with GPU)
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2023/05/01
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【勉強】私立の外部大学院を受験した話(バイオインフォマティクス)
zenzen@R-2
2023/09/03
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再現性がある R 環境の構築
成田智裕
5ヶ月前
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(1) CWLの作成環境をVScodeの｢Dev Containers｣の機能を使って構築する
Sora Yonezawa
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バイオインフォマティクスコンテスト2021参加記
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2021/07/01
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【ゲノム解析】BAMファイルから1座標の塩基割合を求める
Ryota Chijimatsu
2023/09/12
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【WSL】[Bioinformatics] GDC Data Transfer Toolを使ってGDCからデータ取得
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【Plot】[ComplexHeatmap] UpSet Plotから組み合わせパターンごとに遺伝子を取り出す
Ryota Chijimatsu
2023/05/09
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SingularityでQIIME2の実行環境を作成する
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koreeda
2024/02/13
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ロングリードメタゲノムアセンブラー三兄弟の比較 : hifiasm_meta, metaMDBG, metaFlye
はじ環
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BiopythonによるPDBファイル解析
pluie
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俺の転写因子が翻訳されたらIDP（天然変性タンパク質）だった件
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2022/12/24
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SnowflakeでStreamlitとSnowflake Notebooksを用いたIn silico創薬
koreeda
3ヶ月前
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Necatを用いた魚類ゲノムのde novo assembly
はじ環
2023/08/30
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ONTロングリードシーケンシングのデータ解析 (1)
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バイオインフォマティクスコンテスト2021-Problem3 Diagnosis
Kazuki UENO
2021/08/02
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ロングリードメタゲノムのビニング
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2024/01/17
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GenePatternをlocalに導入（docker使用）
Ryota Chijimatsu
2023/10/02
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IGVにゲノムアッセンブリーとアノテーションをマニュアルで登録しかつ遺伝子名を検索可能にする
Zicong Zhang
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バイオインフォマティクス技術者認定試験 参考リンク
バイオサプリ
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小ネタ : parallelにfastpを実行する
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細菌のショットガンメタゲノム Host genome除去
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vcfファイルのCHROM列の染色体番号を0埋めしてSortする
はじ環
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Taxonkitを使って魚種名から対応するtaxidを取得する
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