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1投稿目の挨拶

2023/08/28に公開

はじめに

1投稿目です。環境DNAに関するブログを不定期で更新しています。

https://edna-blog.com/

ただ最近は仕事の都合上ゲノムシーケンスデータを扱うことも多くなってきて、ブログの本筋とは異なる解析の記事を書く場所が欲しくなってきました。

また、見に来る方が専門家ばかりではないブログで、Dryの話ばかりしても面白くないと思ったのでzennのアカウントを作成しました。

こちらには主に環境DNA分析以外のバイオインフォマティクスツールの動作確認や使い方について記載していくつもりです。

多分、メモに近い形になるので自身の環境に落とし込んで有効活用していただければ幸いです。

使用するPCスペック

解析ツールを試してみようと思った時、どの程度のスペックのPCが必要なのかわからない場合があります。
一般的なPCから少し各パーツのスペックを盛った構成にはなっていますが、解析サーバーなどの記載がない場合は、基本的に以下のスペックのPCで解析していると考えていただければと思います。

自作PC1

  • CPU : Ryzen9 5950X 16core 32threds
  • RAM : Kingston DDR4 3200 32GB×4 128GB
  • GPU : NVIDIA GeForce RTX3070Ti
  • Strage : M.2 SSDとHDDを合わせて合計18TB

(自作PCはパソコンへの理解が深まるのでおすすめです)

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