Open6

EpiRHandbook 26 章検証のためのスクラップ

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26 章の準備

## CRAN からパッケージを読み込む
pacman::p_load(rio,          # ファイルのインポート
               here,         # ファイルパスの指定
               tidyverse,    # データ管理 + ggplot2 のグラフ
               tsibble,      # 時系列データセットを扱う
               survey,       # 調査関数
               srvyr,        # survey パッケージ用の dplyr ラッパー
               gtsummary,    # 表作成のための survey パッケージ
               apyramid,     # 年齢ピラミッド作成のためのパッケージ
               patchwork,    # ggplot を組み合わせるためのパッケージ
               ggforce       # 沖積図・サンキーダイアグラム
               ) 

## load packages from github
pacman::p_load_gh(
     "R4EPI/sitrep"          # 観察期間・重み付け関数
)
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sodium R package をインストールするために

$ sudo apt install libsodium-dev
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sitrep R packae をインストールするために

$ sudo apt install libudunits2-dev
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rgdal-config をインストールするために

$ sudo apt install gdal-bin gdal-data  pktools-dev
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magick をインストールするために

$ sudo apt install libmagick++-dev