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【R】Seurat v4のインストール
環境
Windows10
R 4.3.1
Rstudio
はじめに
新しく買ったパソコンにSeurat v4をインストールしようとしたらエラーが出たので記録。
Seurat v4のインストール
Seuratは現在v5がリリースされているが、v4をインストールしようとしてSajitalabのホームページを確認しながらインストールしようとした。
remotes::install_version("SeuratObject", "4.1.4", repos = c("https://satijalab.r-universe.dev", getOption("repos")))
remotes::install_version("Seurat", "4.4.0", repos = c("https://satijalab.r-universe.dev", getOption("repos")))
failed to install 'unknown package' from url:
インストールできない。
インストールのPathを確認してみたり、いろいろしてみたけど結果としては
まっさらな状態のRにインストールしようとしたからコンパイルに必要なパッケージが入ってなかったことが原因でした。
install.packages("curl")
これで先ほどと同じコードを入れればインストールできた。
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