Julia
開発に便利なpackage
Revise.jl
BenchmarkTools.jl
PkgTemplates.jl
Pluto.jl
OhMyREPL.jl
TestEnv.jl
Debugger.jl
Infiltrator.jl
Cthulhu.jl
ProfileView.jl
PProf.jl
TimerOutputs.jl
標準library
@test
-
@profile
https://docs.julialang.org/en/v1/manual/profile/
HPC関連
- PartitionedArrays.jl:分散疎行列
julia> Real <: Complex
false
julia> Char <: String
false
julia> SubString <: String
false
julia> Char <: AbstractString
false
julia> SubString <: AbstractString
true
julia> Char <: AbstractChar
true
julia> String <: AbstractString
true
julia> [1, 1] == [1; 1]
true
julia> [1, 1] == [1 1]
false
2進数⇔10進数
- 2進数は
a=0b11111
のように0b
prefixを書く - 10→2: string(77,base=2) # "1001101"
- 2→10: string(0b1001101) # "77"
https://qiita.com/mametank/items/fa265ed3aa40825ea8e2
Juliaup
以下[channel]
は実際のchannelの名前で置換.
-
julia +[channel]
: juliaの起動(例:julia +release
) -
juliaup add [channel]
: channelの追加 -
juliaup rm [channel]
: channelの削除(juliaup remove
) -
juliaup default [channel]
: default channelの切り替え -
juliaup st
: installされたchannel一覧 (juliaup status
) -
juliaup ls
: install可能なchannel一覧(juliaup list
) -
juliaup up
: channelの更新(juliaup update
)
補足など
- juliaupの更新
- Homebrew以外:
juliaup self update
- Homebrew:
brew upgrade juliaup
- Homebrew以外:
- semantic versioning (x.y.z)以外のchannel
-
release
: 最新版, juliaupを入れた時点で入るdefault -
lts
: 安定版 -
alpha
,beta
,rc
: 開発版
-
あまり使わなさそう
-
juliaup link [channel] [julia_binary]
:既存の[julia_binary]を[channel]として登録(juliaupでinstallしていないchannelを作成可能)
user定義structに四則演算などBase
に定義されている演算子(method)を追加する場合はimport Base.+
のようにimportが必要
函数objectは::Function
でannotateできる
他所のPackageにmultiple dispatchを追加
using Hoge
Hoge.some_function(mystruct::MyStruct) = some_function(...)
- 自分が定義した
Mystruct
に対してHoge
が定義していたsome_function
にsome_function(mystruct::MyStruct)
を追加したい場合,Hoge.some_function(mystruct::MyStruct)
を定義しないといけない. -
some_function(mystruct::MyStruct) = some_function(...)
とした場合,Hoge
に元々定義されていたsome_function
のmultiple dispatchが消えてしまう.
Simulation directoryとsource code directoryの分離
/my/source/code/directory
にmain.jl
と依存先のincludes.jl
があるとして,/my/source/code/directory
とは別の場所で計算を実行したいとする.
そのまま絶対pathでmain.jl
を実行すると依存関係が解決できないので以下のように--project
で依存先を教えてあげる必要がある.
PROJ_DIR=/my/source/code/directory; julia --project=$PROJ_DIR $PROJ_DIR/main.jl
one liner
julia --eval "println(\"hello\")"
foldl
とfoldr
について
tensor_product(x::Vector{Matrix{T}}) where T = foldl(kron, x) :: Matrix{T}
-
kron(kron(kron(x[1], x[2])), x[3]), x[4])
と等価(x
の要素数を4
とした) -
foldr
を使うとkron(x[1], kron(x[2], kron(x[3], x[4])))
と等価になる
(kron
はKronecker積.要using LinearAlgebra
)
Avoid fields with abstract type
構造体を以下のように書くとパフォーマンスに良い
struct MyType{T<:AbstractFloat}
a::T
end
struct MySimpleContainer{A<:AbstractVector}
a::A
end
VScodeのJupyter拡張機能でpackageの環境を使う方法
- Jupyter notebookのkernel選択で分からなくなったのでメモ.
- Jupyter kernelは使いたいJuliaのversionのみ指定すれば良い.
- 最初(Julia環境を有効化したいタイミング)のセルで以下をJupyter notebookから実行すれば良い.
-
activate
する場所はpackageのdirectoryを作成してProject.toml
がある場所を絶対pathかnotebookがある場所からの相対pathで指定する.
using Pkg
Pkg.activate("../")
Pkg.instantiate()
package名の一意性に関する調査
package作成の際にroot dirの名前,Project.toml
のname
entry,src
以下のMyPackage.jl
の名前,moduleの名前が不一致のときどうなるのか調べ,何が一致しなければならないのかを確認する.
確認用のPackage作成
julia REPLを起動して以下を実行
# まだaddしていなければ以下を実行
# ] add PkgTemplates
using PkgTemplates
template = Template(; dir=".")
template("MyPackage.jl")
これでREPLを起動したdirectoryにMyPackage.jl
directoryが作成される.
MyPackage.jl
directoryにProject.tomlが作成され,
name = "MyPackage"
と記載されていることが確認できる.
またsrc
directoryにはMyPackage.jl
というjulia fileが作成されていることも確認できる.
MyPackage.jl
の中身は
module MyPackage
# Write your package code here.
end
となっている.
作成されたpackageの動作確認
REPLをMyPackage
directoryで起動し,以下を実行する
] activate .
using MyPackage
using MyPackage
から特にerror出力なく端末が返ってくることが分かる.
なお,] activate .
の後はpkg modeを抜けるためにbackspaceを押す必要があることに注意.
変更可能箇所の列挙
以下Package名をMyPackage.jl
とする.
- Packageのdirectory名
-
MyPackage.jl
下Project.toml
のname
entry -
MyPackage.jl/src
下MyPackage.jl
のfile名 -
MyPackage.jl/src
下MyPackage.jl
内のmodule名
packageのdirectory名の変更
まず一番無害そうなpackageのdirectory名を変更してみる
mv MyPackage.jl NewMyPackage.jl
特に問題なく動作する.
以下3パターンを検証する.
Project.toml のname
|
実行file名 | module名 |
---|---|---|
NewMyPackage |
MyPackage.jl |
MyPackage |
MyPackage |
NewMyPackage.jl |
MyPackage |
MyPackage |
MyPackage.jl |
NewMyPackage |
Project.toml
のname
entryの変更
以下のようにProject.toml
を修正する.
@@ -1,4 +1,4 @@
-name = "MyPackage"
+name = "NewMyPackage"
状況は以下のようになる.
Project.toml のname
|
実行file名 | module名 |
---|---|---|
NewMyPackage |
MyPackage.jl |
MyPackage |
以下のように動かなくなる.
(@v1.10) pkg> activate .
julia> using MyPackage
ERROR: ArgumentError: Package MyPackage not found in current path.
- Run `import Pkg; Pkg.add("MyPackage")` to install the MyPackage package.
julia> using NewMyPackage
ERROR: ArgumentError: Package NewMyPackage [0fa5efea-465b-4ecc-8393-0dad7f99f1d9] is required but does not seem to be installed:
- Run `Pkg.instantiate()` to install all recorded dependencies.
src/MyPackage.jl
のfile名の変更
続いて,Project.toml
は元に戻して,以下の修正を行う.
mv MyPackage.jl NewMyPackage.jl
状況は以下のようになる.
Project.toml のname
|
実行file名 | module名 |
---|---|---|
MyPackage |
NewMyPackage.jl |
MyPackage |
以下のように動かなくなる.
(@v1.10) pkg> activate .
julia> using MyPackage
ERROR: ArgumentError: Package MyPackage [0fa5efea-465b-4ecc-8393-0dad7f99f1d9] is required but does not seem to be installed:
- Run `Pkg.instantiate()` to install all recorded dependencies.
julia> using NewMyPackage
ERROR: ArgumentError: Package NewMyPackage not found in current path.
- Run `import Pkg; Pkg.add("NewMyPackage")` to install the NewMyPackage package.
module名の変更
実行file名を元に戻した後,以下のように修正を行う.
@@ -1,4 +1,4 @@
-module MyPackage
+module NewMyPackage
状況は以下のようになる.
Project.toml のname
|
実行file名 | module名 |
---|---|---|
MyPackage |
MyPackage.jl |
NewMyPackage |
以下のように動かなくなる.
(@v1.10) pkg> activate .
julia> using MyPackage
Precompiling MyPackage
1 dependency successfully precompiled in 5 seconds
[ Info: Precompiling MyPackage [0fa5efea-465b-4ecc-8393-0dad7f99f1d9]
┌ Warning: The call to compilecache failed to create a usable precompiled cache file for MyPackage [0fa5efea-465b-4ecc-8393-0dad7f99f1d9]
│ exception = Required dependency MyPackage [0fa5efea-465b-4ecc-8393-0dad7f99f1d9] failed to load from a cache file.
└ @ Base loading.jl:1992
┌ Warning: Replacing module `NewMyPackage`
└ @ Base loading.jl:1855
ERROR: package `MyPackage` did not define the expected module `MyPackage`, check for typos in package module name
julia> using NewMyPackage
ERROR: ArgumentError: Package NewMyPackage not found in current path.
- Run `import Pkg; Pkg.add("NewMyPackage")` to install the NewMyPackage package.
まとめ
Project.toml
のname
と実行file名とmodule名は揃えよう.
template Packageの生成
t = Template(user="USERNAME",dir=".";plugins=[ProjectFile(; version=v"0.1.0")])
毎回忘れる
- 自分の場合なぜか毎回GitHubのusernameを明示的に入れないとキレられるので入れてる
USERNAME
は自分のuser名 -
dir="."
はcurrent pathでpackage生成する用.ないと$HOME/.julia
下にdir作る