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Zotero + LaTeX 環境構築と各種使い方

2024/05/29に公開

VS Code

海洋ロボコンをやってた人です。

今回はZotero + LaTeXの環境構築を備忘録として記載していきます。

このノウハウを伝えたい友人に向け、集めた情報をまとめたので参考にしていただければ幸いです。

サマリは以下です。

Zoteroを使用した文献管理 (.bibファイル含む)
LaTeX環境構築
LaTeXのチップス
関連タスクのチップス

本記事に対するコメントも積極的に募集しますので、ご不明点等あれば、よろしくお願いいたします。

1: Zoteroでの文献管理

1.1: Zotero導入とDropbox同期

下記を参照し、ZoteroとDropBoxをインストールし、同期設定までを行います。

編集 > 設定から、ZoteroとDropBoxの詳細環境設定も行うようにします。

私の設定内容は以下となっています。

1.2: Zoteroのアドオン追加

以下記載の通り、「ZotFile」と「Better BibTeX for Zotero」を追加します。

ZotFile

添付ファイル管理のアドオンで、Zoteroアイテムへの添付を自動で行い、PDFの同期が可能です。
DropBoxで同期するために必要。

Better BibTeX for Zotero

Webページから各種引用情報を取得し、.bibtexファイルへ書き出しが可能になるため、文献管理を効率化できます。

Wordで参考文献を手打ちしている時代からは解放されるため、誤記対策にもなりオススメです。

Zotero以外に、Mendeleyでも.bibファイル出力できるので機関版が使用可能な場合はMendeleyでも良いと思います。

以下、手順

・右クリック > 添付ファイルを追加する > リンクをファイルに添付する

・マイ・ライブラリ内のフォルダを右クリック > コレクションをエクスポート > Keep updatedにチェックを入れてOK

bibtexへ出力される内容を手動で修正する場合は「レイアウト > アイテムパネル」から修正できる

.bibファイルで保存した文献をLaTexで使用する場合、主に以下の2パターンをメインに使用すると思うので、その例も以下に示しておきます。

\citep{haoCourseControlManta2022}  // (Hao et al., 2022)という全体()表記
\citet{haoCourseControlManta2022}  // Hao et al. (2022)という年号のみ()表記

2: LaTeX環境構築

2024年、overleaf + vscode対応が可能になったようですが、複雑な文章を書く上ではLaTeXの方が装飾をしやすいと思っているため、こちらで環境構築を行います。

2.1: LaTeX導入

Windowsの場合
Windowsの場合は、すでに先駆者が素晴らしい記事を執筆されているので以下を参考にTeX Liveをインストールし、設定を進めます。

Ubuntuの場合

Ubuntuの場合は以下よりDLすれば使用できます。

terminal

sudo apt-get update
sudo apt-get install texlive-latex-extra -y
sudo apt-get install latexmk
latex --version

VScodeのプラグインとしてLaTeX Workshopもインストールしておきましょう。

2.2: LaTeX-Templateを入手する

環境構築が終わったら、実際にLaTeX環境を試してみましょう。

すでに使用するテンプレートがあればそちらで試してください。

手元で試せるテンプレートがない場合、OSSも公開されているのでテスト動作の確認まで進めておくと良いと思います。

必須ファイル

上記を例に、入手ファイルの内、以下5つのファイルがあれば、els-cas-templatesはビルドできます。
場合によってfigsやthumbnailsフォルダを活用してください。

bibtex.bib (*.bib)
cas-common.sty
cas-dc.cls
cas-model2-names.bst
manuscript.tex (*.tex)

3: LaTeX記述のチップス

以下、LaTeX記述する上で使用頻度の高い記述をチップスで殴り書きします。（不定期アップデート予定）

3.1: Section/SubSection

%============= 1. INTRODUCTION ============= 
\section{Introduction}

% Subsection 1.1
\subsection{Background}

3.2: Figure/Table/Equation

1 Figure

% ===== Fig 1 ===== %
\begin{figure}[t] \label{fig:Fig1}
  \centering
  \resizebox*{10cm}{!}{\includegraphics{Fig1.jpg}}\hspace{5pt}
  \caption{ROS 2 node interface.} 
\end{figure}

2 figures (a), (b)

% ===== Fig 2 ===== %
\begin{figure}[t] \label{fig:Fig2}
  \centering
  \subfloat[ROS 2 node interface.]{% (a)
  \resizebox*{7cm}{!}{\includegraphics{Fig1a.jpg}}}\hspace{5pt}
  \subfloat[ROS 2 topic]{% (b)
  \resizebox*{6cm}{!}{\includegraphics{Fig1b.jpg}}}
  \caption{ROS 2 service}
\end{figure}

Table

% ===== Table 1 ===== %
\begin{table}[t] \label{table:tbl1}
  \tbl{Technical specifications of the xxx robot.}
  {\begin{tabular}{lcc} \toprule
    Items & Characteristics \\ \midrule
    Length×Width×Height & xx m×xx m×xx m \\
    Weight & xx \\
  \end{tabular}} 
\end{table}

\label でラベルを使用すると、以下のようにハイパーリンクを埋め込めます。

Figure \hyperref[fig:Fig2]{2} shows the ...

Equation matrix

\begin{equation} \begin{aligned} & ^{0}P_1 = \begin{bmatrix} a_{11} & a_{12} & a_{13} & a_{14} \\ a_{21} & a_{22} & a_{23} & a_{24} \\ a_{31} & a_{32} & a_{33} & a_{34} \\ a_{41} & a_{42} & a_{43} & a_{44} \end{bmatrix} \begin{bmatrix} a_{11} & a_{12} & a_{13} & a_{14} \\ a_{21} & a_{22} & a_{23} & a_{24} \\ a_{31} & a_{32} & a_{33} & a_{34} \\ a_{41} & a_{42} & a_{43} & a_{44} \end{bmatrix}\\ \end{aligned} \end{equation}

 % ===== Equation (1) ===== %
 \begin{equation}\label{eq:eq1}
  \begin{aligned}
    & ^{0}P_1 = \begin{bmatrix}
      a_{11} & a_{12} & a_{13} & a_{14} \\
      a_{21} & a_{22} & a_{23} & a_{24} \\
      a_{31} & a_{32} & a_{33} & a_{34} \\
      a_{41} & a_{42} & a_{43} & a_{44}
    \end{bmatrix} \begin{bmatrix}
      a_{11} & a_{12} & a_{13} & a_{14} \\
      a_{21} & a_{22} & a_{23} & a_{24} \\
      a_{31} & a_{32} & a_{33} & a_{34} \\
      a_{41} & a_{42} & a_{43} & a_{44}
    \end{bmatrix}\\
  \end{aligned}
\end{equation}

Equation aligned

\begin{equation} \begin{aligned} &\theta_{1} = \omega_{1} t \\ &\theta_{2} = \omega_{2} t \\ \end{aligned} \end{equation}

% ===== Equation 2 ===== %
\begin{equation}\label{eq:eq2}
	\begin{aligned}
	  &\theta_{1} = \omega_{1} t \\  
      &\theta_{2} = \omega_{2} t \\  
	\end{aligned}
\end{equation}

Other-eq

以下で検索すれば、大体の数式は記述することができます。執筆された方、ありがとうございます。

https://mathlandscape.com/latex-eq/

3.3: Revised

以下を参考に、\Add, \Eraseを使用してRevisedの作成が可能です。

2回目以降はラベル名を\AddRevとか適当に変えれば、追加でSecond Revisedも可能です。

こちらも執筆された方、ありがとうございます。

ここまで読み進めて頂いた読者ならご想像の通りのタスクになります。

置かれた環境でノウハウがない場合、一から情報収集するのは大変なので以下に関連タスクを記載しておきます。

Cover Letter

以下を参考に、丁寧に作成します。

How to Write an Effective Cover Letter for Journal Submission | Example Cover Letter

臨床研究論文作成マニュアル

major revision

Rejectされなかったので、素晴らしいです。誇りをもってrevisionに挑みましょう。多くの学びを得られるチャンスなのですべての問いに対して的確にかつ端的に記述していきます。

ジャーナルから「major revision」と言われたら・・・どうする？

Extend the Revision

期日を延長したいときに、メールを送ると対応してもらえることが多いので交渉する価値はあると思います。

交渉すれば、よほどのことがない限りExtendをapproveしてもらえます。

ジャーナルへの連絡：再投稿の期限延長を希望する

期日延長｜投稿論文の修正期限が短い時の対処法

Response to Reviewer

以下を参考に、Responseを記述していきます。

査読者への回答　その１

How to Review

調べている途中に見つけたので、メモ書き。

Zotero + LaTeX 環境構築と各種使い方

1: Zoteroでの文献管理

1.1: Zotero導入とDropbox同期

1.2: Zoteroのアドオン追加

2: LaTeX環境構築

2.1: LaTeX導入

2.2: LaTeX-Templateを入手する

必須ファイル

3: LaTeX記述のチップス

3.1: Section/SubSection

3.2: Figure/Table/Equation

3.3: Revised

Reference

Discussion

1: Zoteroでの文献管理

1.1: Zotero導入とDropbox同期

1.2: Zoteroのアドオン追加

2: LaTeX環境構築

2.1: LaTeX導入

2.2: LaTeX-Templateを入手する

必須ファイル

3: LaTeX記述のチップス

3.1: Section/SubSection

3.2: Figure/Table/Equation

3.3: Revised

4: Related tasks

Reference

Discussion