Zenn
Closed5

Python-MIP をM1 Mac × dockerで動かす

ピン留めされたアイテム
たにしたにし

解決方法

FROM python:3.10.5-buster

...略(pip installなど)

# m1対応
RUN apt-get install -y wget bash git gcc g++ gfortran  liblapack-dev libamd2 libcholmod3 libmetis-dev libsuitesparse-dev libnauty2-dev
RUN wget -nH https://raw.githubusercontent.com/coin-or/coinbrew/master/coinbrew
RUN chmod u+x coinbrew
RUN bash coinbrew fetch Cbc@master
RUN bash coinbrew build Cbc@master --no-prompt --prefix=/usr/local --tests=none --enable-cbc-parallel
ENV PMIP_CBC_LIBRARY="/usr/local/lib/libCbc.so"
ENV LD_LIBRARY_PATH="/home/haroldo/prog/lib"

...略

ポイント

  • slimではなく、busterなどのイメージを使用
  • wgetで取得した後、chmodで権限を付与
  • 公式に記載されている依存pkgをinstall
  • 環境変数を設定
    • PMIP_CBC_LIBRARY："/usr/local/lib/libCbcSolver.so" ではなく、"/usr/local/lib/libCbc.so"
たにしたにし

このスクラップについて

表題通り。現状のversionだとサポートされていないので動かない。その解決方法をこちらに残す

OS: Mac OS (M1)
image: python:3.10.5-slim
python-mip: 1.14

参考になりそうな情報源

たにしたにし

発生している現象

mipを叩くと以下のようなエラーが発生する

...略
name 'cbclib' is not defined

これを解決したい

たにしたにし

原因

https://python-mip.readthedocs.io/en/latest/install.html

Using your own CBC binaries (optional)
Python-MIP provides CBC binaries for 64 bits versions of MacOS, Linux and Windows that run on Intel hardware. These binaries may not be suitable for you in some cases:

  • macOSにおいて、x86までしかサポートされてないとのこと。

対応方針

たにしたにし

対応ログ： cbc周り

Dockerfile

dependencyが公式に書いてあるのでそれを参考

sudo apt-get install gcc g++ gfortran libgfortran-9-dev liblapack-dev libamd2 libcholmod3 libmetis-dev libsuitesparse-dev libnauty2-dev git

FROM python:3.10.5-slim

...略
# m1対応
RUN apt-get install -y wget bash git build-essential gcc g++ gfortran libgfortran-9-dev liblapack-dev libamd2 libcholmod3 libmetis-dev libsuitesparse-dev libnauty2-dev
RUN wget -nH https://raw.githubusercontent.com/coin-or/coinbrew/master/coinbrew
RUN chmod u+x coinbrew
RUN bash coinbrew fetch Cbc@master
RUN bash coinbrew build Cbc@master --no-prompt --prefix=/usr/local --tests=none --enable-cbc-parallel
ENV PMIP_CBC_LIBRARY="/usr/local/lib/libCbc.dylib"
ENV LD_LIBRARY_PATH="/home/haroldo/prog/lib/"

*build-essential はなくてもいいかも

実行時のエラー

#17 14.88 configure:19699: error: "Cannot check for existence of module lapack without pkgconf"

各所で以下のエラー

#17 14.88 configure:19269: g++ -o conftest -O2 -DNDEBUG    conftest.cpp -lmkl_intel_lp64 -lmkl_sequential -lmkl_core -lm  >&5
#17 14.88 /usr/bin/ld: cannot find -lmkl_intel_lp64
#17 14.88 /usr/bin/ld: cannot find -lmkl_sequential
#17 14.88 /usr/bin/ld: cannot find -lmkl_core
#17 14.88 collect2: error: ld returned 1 exit status
#17 14.88 configure:19269: $? = 1
#17 14.88 configure: failed program was:
  • makeで「/usr/bin/ld: cannot find」と表示されるときは、-lオプションに続くパッケージ（ここでは「Xi」）に関連するライブラリがインストールされていないことを示している (引用)
  • lmk;：Intel math Kernel library(Intel MKL)
#17 14.88 configure:18475: result: no
#17 14.88 configure:18486: checking for g++ options needed to detect all undeclared functions
#17 14.88 configure:18508: g++ -c -O2 -DNDEBUG   conftest.cpp >&5
#17 14.88 conftest.cpp: In function 'int main()':
#17 14.88 conftest.cpp:43:8: error: 'strchr' was not declared in this scope
#17 14.88    43 | (void) strchr;
#17 14.88       |        ^~~~~~
#17 14.88 conftest.cpp:1:1: note: 'strchr' is defined in header '<cstring>'; did you forget to '#include <cstring>'?
#17 14.88     1 | /* confdefs.h */
#17 14.88 configure:18508: $? = 1
#17 14.88 configure: failed program was:

#17 14.88 configure:18475: result: no
#17 14.88 configure:18475: checking for ieeefp.h
#17 14.88 configure:18475: g++ -c -O2 -DNDEBUG   conftest.cpp >&5
#17 14.88 conftest.cpp:67:10: fatal error: ieeefp.h: No such file or directory
#17 14.88    67 | #include <ieeefp.h>
#17 14.88       |          ^~~~~~~~~~
#17 14.88 compilation terminated.
#17 14.88 configure:18475: $? = 1
#17 14.88 configure: failed program was:

slim起因な気がするので、image変更

FROM python:3.10.5-buster

apt-get から libgfortran-9-devを削除(not foundなため)

環境変数周りがおかしかったので調整

このスクラップは2023/02/27にクローズされました