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Windows11 + WSL で Obsidian を快適に使うまでの試行錯誤

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はじめに

みなさん、Obsidian 使ってますか？ Markdownベースで、チームのドキュメントから個人の知識整理までできる最強ノートアプリです。

でも、自分は開発を WSL（Ubuntu） に寄せていて、そこで管理しているGitHubプロジェクトを Windows版Obsidian で開こうとしたら大ハマりしました…。

今回はその体験談と、最終的にたどり着いた「快適に使う方法」をまとめます ✍️

🎯 この記事のゴール

  • WindowsでもMac上司と同じVaultを開ける！
  • 「Windows版」「WSL版」を用途で使い分けられるようになる！
  • ドキュメント中心のプロジェクトはWindowsで、Linux依存のものはWSLで という運用に整理する

Step 1. ❌ Windows側にクローンしてみた

まずやったのはシンプルに

git clone git@github.com:yourname/your-project.git

を Windows側 で実行。

が、エラー。

error: invalid path 'docs/folder/some-file v1->v2.md'
fatal: unable to checkout working tree

そう、レポジトリを作った人がLinux環境なので、WindowsではNGな文字（>）がファイル名に含まれていたんです。

👉 つまり「WindowsにcloneしてもObsidianで開けない」ことが判明。

Step 2. ❌ Windows版ObsidianでWSLのフォルダを開いてみた

じゃあWSL内を直接見ればいいのでは？と、 \\wsl$\Ubuntu\home\username\Documents\project\your-project をWindows版Obsidianで開いてみました。

が、これもアウト。

EISDIR: illegal operation on a directory, watch

ObsidianはVault内をリアルタイムで監視するんですが、WSLフォルダはWindowsから見ると「ネットワークドライブ扱い」。

監視が効かず、ファイル更新が反映されないどころか落ちるという悲劇…。

Step 3. ✅ 解決！WSL内にLinux版Obsidianをインストール

最終的に行き着いたのがこれ。

👉 WSLにLinux版Obsidianを入れて、WSLgでGUIを動かす

手順

1. systemd有効化

sudo nano /etc/wsl.conf

以下を追加：

[boot]
systemd=true

WSLを再起動（PowerShellで実行）：

wsl --shutdown

2. Flatpak導入

sudo apt update && sudo apt upgrade -y
sudo apt install -y flatpak
sudo flatpak remote-add --if-not-exists flathub https://flathub.org/repo/flathub.flatpakrepo

3. Obsidianインストール

sudo flatpak install -y flathub md.obsidian.Obsidian

4. 起動

flatpak run md.obsidian.Obsidian

💡 Windows 11 のWSLgのおかげで、Linux版Obsidianが普通にGUIで立ち上がります！

Step 4. 🚀 運用スタイルを整理する

ここまでで「Mac上司と同じVaultをWSLで開ける」ようになりました。

さらに、用途によってObsidianを分けると超快適になります。

Windows版 Obsidian

  • 自分のプライベートなノート、日記、軽いドキュメント整理
  • ファイル監視も安定、サクサク

WSL版 Obsidian

  • Linux/macOS前提で作られたチームプロジェクト
  • ファイル名に>とかあってもそのまま開ける
  • Mac上司と同じVaultを共有できる

👉 つまり、Windowsでできる作業はWindowsでやる。Linux依存のものはWSLでやる。

この住み分けが一番スッキリしました。

🎉 まとめ

  • Windows版ObsidianでWSLフォルダを直接開くのはエラーのもと
  • Linuxユーザーが作ったリポジトリはWindowsにそのままcloneできないこともある
  • 最適解：WSLにLinux版Obsidianを入れる！
  • さらに、用途で「Windows版」と「WSL版」を使い分けると快適

…そもそもMacに買い替えればそれが一番早い気もする…

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