FishBase API を使ってみる

ピン留めされたアイテム

rin

REST は死んでて、rfishbase から使うことになってるらしい
https://github.com/ropensci/rfishbase

rin

ドキュメント: https://ropensci.github.io/fishbaseapidocs/

rin

sealifebase なるものもあったのか https://www.sealifebase.org/search.php
たしかに海産哺乳類のデータ入ってた

rin

The current versions for Fishbase are:

201505

201604

201703

API はバージョン追従が遅いのか？

rin

Postman workspace 作った: https://www.postman.com/rindrics/fishbase/overview

rin

まず curl から使ってみる

rin

curl -L https://fishbase.ropensci.org/heartbeat
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<Error><Code>AccessDenied</Code><Message>Access Denied.</Message><BucketName>heartbeat</BucketName><Resource>/heartbeat</Resource><RequestId>183DAA9A927905C8</RequestId><HostId>dd9025bab4ad464b049177c95eb6ebf374d3b3fd1af9251148b658df7ac2e3e8</HostId></Error>%

rin

認証いらないって書いてあるけどな？
https://ropensci.github.io/fishbaseapidocs/?http#authentication
ドキュメントが古い？

rin

https://fishbase.ropensci.org/heartbeat のほうはだめかもな

rin

Cached versions of the fishbase tables are available over the popular AWS S3 API, though these are not currently documented!
though these are not currently documented!
oh...

rin

R からなら使えるらしい

REST は死んでるって

rin

rfishbase はどうやってアクセスしている？

https://github.com/ropensci/rfishbase

rin

parquet をダウンロードしてそこにクエリする形らしい

parquet をホストしているのはどこ？

rin

huggingface かな

rin

あった

rin

parquet たくさんあった

rin

やはり rfishbase から使うが正攻法か