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GCP上でJupyterHubをインストールした時に出たCondaUpgradeErrorを解決した

2020/11/19に公開
Python
JupyterHub
tech

発生した問題

こちらの手順でSTEP3の手順通りsudo -E conda install -c conda-forge gdalを実行してみたところ、以下のエラーが出てきました。

CondaUpgradeError: This environment has previously been operated on by a conda version that's newer
than the conda currently being used. A newer version of conda is required.
  target environment location: /opt/hoge/user
  current conda version: 4.5.8
  minimum conda version: 4.8

解決策

こちらのドキュメントに解決策が書いていました。

EXAMPLE: If my conda info says package cache : /opt/conda/pkgs and my Python version is 3.7, then on the command line, type conda install /opt/conda/pkgs/conda-4.6.1-py37_0.tar.bz2 to resolve the issue.
https://docs.conda.io/projects/conda/en/latest/user-guide/troubleshooting.html#conda-upgrade-error

こちらの通り、パッケージキャッシュを利用することで解決しました。

以下の様にconda infoを実行するとパッケージキャッシュのパスが出てくるので、そのパスの中で一番新そうなcondaパッケージをインストールするとエラーが出なくなりました。（私の場合はconda-4.7.10-py37_0.tar.bz2でした）

$ conda info
...
package cache : /opt/hoge/user/pkgs
...
$ sudo -E conda install /opt/hoge/user/pkgs/conda-4.7.10-py37_0.tar.bz2
$ sudo -E conda install conda

補足

Change the .condarc file. Set the parameter by editing the .condarc file directly: allow_conda_downgrades: true in conda version 4.5.12. This will then let you upgrade. If you have something older than 4.5.12, install conda 4.6.1 again from the package cache.

上記の方法も書いてあったのですが、.condarcを書き換えても上手くいかなかったので、この方法でやることにしました。

あと、このErrorはインスタンス削除して作り直してみた時には再現しなかったので、よく分からない。

参考文献

https://docs.conda.io/projects/conda/en/latest/user-guide/troubleshooting.html#conda-upgrade-error

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