R/RStudioでyamlファイルを使ってパッケージ管理をしてみる

概要

RStudioでProjectを利用してコーディングを進める際に，パッケージ管理をシンプルにしたいというモチベーションで，
今回はyamlでパッケージ管理を外出ししてみました．

Rでyamlを扱う

Rではデフォルトでyamlファイルを扱う関数は提供されていないので，ここではyamlパッケージを使います．
本末転倒ですが，yamlをインストール・インポートする処理だけは.Rprofileに記述しておきます．

options(repos="https://cran.ism.ac.jp/")
require(utils)

force_library <- function(pkg){
  if(!require(pkg, character.only = T)){
    install.packages(pkg)
    require(pkg, character.only = T)
  }
}

force_library("yaml")

また，yamlのファイル名はconfig.yamlとしました．

yaml側

ここでは，以下の３つのパッケージを自動で読み込みたいとします．

packages:
  - tidyverse
  - tidymodels
  - ranger

読み込み処理

yaml::read_yaml()でyamlファイルを読み込むと，以下のようにリスト形式のオブジェクトが生成されます．

> read_yaml("config.yaml")
$packages
[1] "tidyverse"  "tidymodels" "ranger"    

あとは.Rprofileに逐次読み込み処理を追記していくだけです．

options(repos="https://cran.ism.ac.jp/")
require(utils)

force_library <- function(pkg){
  if(!require(pkg, character.only = T)){
    install.packages(pkg)
    require(pkg, character.only = T)
  }
}

force_library("yaml")

# ここから追記
config <- read_yaml("config.yaml")
for(pkg in config$packages){
  force_library(pkg)
}

終わりに

• yamlの方が編集がしやすいと思いました．
• write_yaml関数を使って現在の設定を書き出すのもあり
• yamlにバージョンも追記してあればそれを読み込む，みたいなカスタマイズもありですね