Open1
snakemake8の設定
まずは、テスト用のsnakemakeファイル
#snakemake -j 4 -s smktest.smk --profile sge --printshellcmds --latency-wait 600
rule all:
input:
"date.txt",
"hostname.txt"
rule get_date:
output:
"date.txt"
shell:
"date > {output}"
rule get_hostname:
output:
"hostname.txt"
shell:
"hostname > {output}"
実行コマンド
snakemake -j 4 -s smktest.smk --profile sge --printshellcmds --latency-wait 600