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Vertex AI Workbenchユーザー管理ノートブック インスタンス上でRStudio Serverを動かす

2023/03/14に公開
R
RStudio
Vertex AI
tech

はじめに

Vertex AI Workbenchユーザー管理ノートブック インスタンスにRStudio Serverをインストールして動かしたのでそのメモです。

手順

Vertex AI Workbenchで新規インスタンスの作成

  • Vertex AI Workbenchユーザー管理ノートブックのコンソール https://console.cloud.google.com/vertex-ai/workbench/user-managed にアクセスします。

  • NEW NOTEBOOKを押下して、新しいインスタンスを作成します。このとき、R 4.2を選択します。

  • インスタンスが起動し、OPEN JUPYTERLABが押下できるようになったら押下してJupyterlabを起動します。

RStudio Serverのインストール

  • Jupyterlab内でTerminalを起動します。

  • https://posit.co/download/rstudio-server/ を参照して、RStudio Serverをインストールします。Select Your Operating System:は、Debian / Ubuntuです。今回は以下の3つのコマンドでした。

sudo apt-get install gdebi-core

wget https://download2.rstudio.org/server/bionic/amd64/rstudio-server-2022.12.0-353-amd64.deb

sudo gdebi rstudio-server-2022.12.0-353-amd64.deb

ユーザー追加

  • RStudioにログインするためのユーザーとパスワードを設定します。
  • RStudioのユーザーとパスワードは、インスタンス上のユーザーとパスワードであるため、そのままJupyterlab内のターミナルで以下のコマンドを実行します。
$ sudo adduser kn1kn1
Adding user `kn1kn1' ...
Adding new group `kn1kn1' (1011) ...
Adding new user `kn1kn1' (1010) with group `kn1kn1' ...
Creating home directory `/home/kn1kn1' ...
Copying files from `/etc/skel' ...
New password: 
Retype new password: 
passwd: password updated successfully
Changing the user information for kn1kn1
Enter the new value, or press ENTER for the default
        Full Name []: 
        Room Number []: 
        Work Phone []: 
        Home Phone []: 
        Other []: 
Is the information correct? [Y/n] Y
$

SSHポート転送を使用して、RStudioに接続

RStudioにブラウザでアクセスします。ファイアウォールの設定等が煩雑なため、SSHポート転送を使用します。

https://cloud.google.com/architecture/running-rstudio-server-on-a-cloud-dataproc-cluster?hl=ja#connect_through_ssh_port_forwarding の手順を参考にしました。

  • ローカルマシンのターミナルで、以下のコマンドを実行して、ポート転送します。INSTANCE_NAMEは、Compute Engineのコンソール https://console.cloud.google.com/compute/instances から調べていくと良いでしょう。
gcloud compute ssh \
    --zone=ZONE \
    --project=PROJECT_ID \
    INSTANCE_NAME -- \
    -L 8787:localhost:8787
  • http://localhost:8787/ にアクセスします。ログイン画面が表示されたら、先程作成したユーザーとパスワードを入力してログインします。

おわりに

以前はCompute EngineのインスタンスにRをインストールするところからやっていたのですが、Vertex AI WorkbenchでRがインストールされた状態のインスタンスが提供され、かなり手順を軽減できるようになったと感じました。

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