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乳がん関連画像データセットのまとめ

2023/05/25に公開

大学院で乳がん関連の研究をしているので、公開されている画像データセットについてまとめました。

VinDr-Mammo: A large-scale benchmark dataset for computer-aided diagnosis in full-field digital mammography

https://vindr.ai/datasets/mammo
dcmファイル
BI-RADS分類(10000)
高濃度乳房(10000)
ROIの矩形アノテーション情報がある

Breast Cancer Image Segmentation Attention UNet

https://www.kaggle.com/datasets/utkarshsaxenadn/breast-cancer-detection-unet
pngファイル
超音波画像
benign(437)/normal(133)/malignant(210)に分けられていて、それぞれにマスク画像がある。

BREAST-DIAGNOSIS

https://wiki.cancerimagingarchive.net/display/Public/BREAST-DIAGNOSIS
dcmファイル(総数未調査)
マンモグラフィ、PET、CT、MRI
Benign/Malignant等の情報が見当たらない

Categorized Digital Database for Low energy and Subtracted Contrast Enhanced Spectral Mammography images(CDD-SESM)

https://wiki.cancerimagingarchive.net/pages/viewpage.action?pageId=109379611
jpgファイル
Low energy images(1003)/Subtracted images(1003)
normal/cancer/benign
VIA(VGG Image Annotator)によると思われる画像アノテーションjasonデータ(polygon/ellipse/circle/point)がある。
[参考]https://deep-architecture.hatenablog.com/

Curated Breast Imaging Subset of Digital Database for Screening Mammography (CBIS-DDSM)

https://wiki.cancerimagingarchive.net/pages/viewpage.action?pageId=22516629
dcmファイル
Calc/Massに分けられたマンモグラフィ画像で、マスク画像もある
Calc/MassはそれぞれTrain/Testに分けられている
Benign/Malignant

rsna-breast-cancer-detection

https://www.kaggle.com/competitions/rsna-breast-cancer-detection
dcmファイル
train(54706)/test(4)に分けられたマンモグラフィ画像
trainにはcancer(0 or 1)の情報がある

The Chinese Mammography Database(CMMD)

https://wiki.cancerimagingarchive.net/pages/viewpage.action?pageId=70230508
dcmファイル
Benign(1172)/Malignant(4150)に分けられたマンモグラフィ画像

The mini-MIAS database of mammograms

http://peipa.essex.ac.uk/info/mias.html
pgmファイル([参考]https://fes.wiki/extension/pgm)×322
Normal/Benign/Malignant
マンモグラフィ画像

The VICTRE Trial

https://wiki.cancerimagingarchive.net/display/Public/The+VICTRE+Trial%3A+Open-Source%2C+In-Silico+Clinical+Trial+For+Evaluating+Digital+Breast+Tomosynthesis
dcmファイル ×2986(未確認)
3Dマンモグラフィ(トモシンセシス)

The Digital Database for Screening Mammography (DDSM)

http://www.eng.usf.edu/cvprg/Mammography/Database.html
normal/cancer/benign/bwc(benign_without_callback)に分けられた、いろいろなファイル形式のマンモグラフィ画像
ftpでデータをダウンロードするのが非常に困難で未入手

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