【初心者向け】ネットワーク薬理学を使ったin silico創薬 〜漢方、食材から医薬品候補を見つけてみよう~
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【初心者向け】ネットワーク薬理学を使ったin silico創薬 〜漢方、食材から医薬品候補を見つけてみよう~
【初心者向け】ネットワーク薬理学を使ったin silico創薬 〜漢方、食材から医薬品候補を見つけてみよう~
01前書き02構成(目次)03📘 第0章:本書の目的と概要04📰 ネットワーク薬理学とは05📰 本書でフォローする論文と流れ06📰 同様の流れで執筆されている論文たち07📘 第1章:漢方成分の抽出08📰 Pubchem による成分抽出09📰 スクレイピングと API を使った化合物情報の取得の環境構築10📰 スクレイピングと API を使った化合物情報の取得11📰 API を使った SMILES の取得12📰 化合物のフィルタリング13📘 第2章:化合物からの標的タンパク質予測14📰 ChEMBL Multitask Neural Network model とは15📰 環境構築16📰 ChEMBL Multitask Neural Network mode を使ったターゲット予測17📰 Target の UniProt_ID の追加18📰 標的の多い化合物の抽出19📰 標的の抽出20📘 第3章:疾患からの標的タンパク質の予測21📰  Open Targets とは22📰 Open Targets を使った疾患の標的タンパク質の検索23📰 globalScore でのフィルタリング24📘 第4章:成分と疾患との共通標的の発見25📰  Intervene とは26📰 Intervene を使った漢方成分と疾患の共通標的の発見27📰 Intervene を使ったベン図の作成28📘 第5章:タンパク質相互作用ネットワーク構築と重要タンパク質の発見29📰  タンパク質相互作用 ネットワークとは30📰 Cytoscape を使ったタンパク質相互作用ネットワークの可視化31あとがき32本書で用いられたツール一覧、ライセンス
Chapter 01無料公開

前書き

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2025.08.06に更新