In silicoペプチド創薬の教科書

In silicoペプチド創薬の教科書

📰 概要 In silicoペプチド創薬の技術を体系的に学び、実験に進む前段階を“PCだけ”で完結させたい方へ。 本書は、Wetでペプチド創薬を専門にしていた著者が、その後 in silico 創薬を学び、 ペプチド創薬を「In silico」という視点から整理・実装した技術書です。 環境構築から具体的な操作方法、つまずきやすいポイントやエラーの考え方まで含め、 「In silicoペプチド創薬を自分の研究に取り入れる」ことをゴールに構成しています。 本書で紹介する手法は、近年の論文で実際に用いられているアプローチを中心としております。 この一冊を通して、In silico ペプチド創薬を学び、実験設計や論文化へとつなげてみませんか。 👫 対象とする読者 ・ペプチド創薬に興味はあるが、In silicoは未経験の方 ・in vitro スクリーニングの限界を感じ、新しい探索手法を探している研究者 ・低分子の in silico 創薬経験はあるが、ペプチドには踏み出せていない方 ・自分のペプチド配列を、計算機上で評価・比較したい方 💰 販売価格 期間限定で ¥3000→¥2000 (約33% OFF!!)で販売しております! 本技術書は随時アップデートされます。 一度ご購入いただいた方は、今後のアップデートも追加料金なしでご利用いただけますので、ご安心ください。 📰 アップデート情報 2026/01/24: リリースしました!

Chapters
Chapter 01無料公開

まえがき

Chapter 02無料公開

構成(目次)

Chapter 03無料公開

📘 第0章:創薬モダリティとしてのペプチド

Chapter 04無料公開

📘 第1章:RFPeptide、Protein MPNN、AlphaFoldを用いた新規環状ペプチドの創出

Chapter 05無料公開

📰 RFPeptideとは?

Chapter 06無料公開

📰 RFPeptideの仕組み

Chapter 07無料公開

📰 RFPeptideの環境構築

Chapter 08

📰 RFPeptideの実行

Chapter 09無料公開

📰 RFPeptideの実行結果

Chapter 10無料公開

📰 ProteinMPNNとは?

Chapter 11無料公開

📰 ProteinMPNNの環境構築

Chapter 12

📰 ProteinMPNNの実行

Chapter 13無料公開

📰 ProteinMPNNの実行結果

Chapter 14

📰 AlphaFold2での構造予測

Chapter 15無料公開

📰 AlphaFold2での構造予測結果

Chapter 16無料公開

📘 第2章:Autodock CrankPepによる環状ペプチドの分子ドッキング

Chapter 17無料公開

📰 Autodock CrankPepとは?

Chapter 18無料公開

📰 Autodock CrankPepの環境構築

Chapter 19

📰 Autodock CrankPepの実行

Chapter 20

📰 Autodock CrankPepの実行結果

Chapter 21無料公開

📘 第3章:PRODIGYを用いた環状ペプチド-タンパク質結合エネルギーの予測

Chapter 22無料公開

📰 PRODIGYとは?

Chapter 23無料公開

📰 PRODIGYのアルゴリズム

Chapter 24

📰 PRODIGYのブラウザからの利用

Chapter 25無料公開

📰 PRODIGYの実行結果

Chapter 26無料公開

📰 PRODIGYのコマンドラインからの利用(環境構築)

Chapter 27

📰 PRODIGYのコマンドラインからの利用(実行)

Chapter 28無料公開

📰 PRODIGYのコマンドラインからの利用(結果)

Chapter 29無料公開

📘 第4章:環状ペプチドのin silico screening

Chapter 30無料公開

📰 ライブラリ、HELM形式、アラニンスキャニング、ホモログスキャニングとは?

Chapter 31

📰 環状ペプチドライブラリ構築の環境構築

Chapter 32

📰 環状ペプチドライブラリ構築の実行コード

Chapter 33

📰 環状ペプチドライブラリ構築のコード詳細解説

Chapter 34無料公開

📰 環状ペプチドライブラリ構築の結果

Chapter 35無料公開

📰 環状ペプチドのin silico screeningの流れ

Chapter 36

📰 環状ペプチドのin silico screeningの環境構築

Chapter 37

📰 環状ペプチドのin silico screeningの実行コード

Chapter 38

📰 環状ペプチドのin silico screeningのコード詳細解説

Chapter 39無料公開

📰 環状ペプチドのin silico screeningの結果

Chapter 40無料公開

📘 第5章:mobiusによるベイズ最適化を用いたペプチドin silicoスクリーニング

Chapter 41無料公開

📰 mobius、ベイズ最適化(Bayesian Optimization)とは?

Chapter 42無料公開

📰 mobius環境の構築

Chapter 43

📰 mobiusによるベイズ最適化の実行

Chapter 44

📰 mobiusによるベイズ最適化のコード解説

Chapter 45無料公開

📰 結果の可視化

Chapter 46無料公開

あとがき

Chapter 47無料公開

謝辞

Chapter 48無料公開

共同研究について

Chapter 49無料公開

書評:バイオインフォマティクス研究支援事業を手がけている くろたんくLabさま より

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LabCode(ラボコード)
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本文更新
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文章量
121,613
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2,000
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